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Inhibicion enzimatica en el Laboratorio, Apuntes de Química

Describe el procedimiento practico para determinar la inhibición enzimática

Tipo: Apuntes

2022/2023

Subido el 11/07/2025

cristian_luna
cristian_luna 🇪🇨

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Inhibición enzimática
La actividad de una enzima puede ser disminuida o eliminada completamente por la
acción de ciertas sustancias a las cuales se las conoce con el nombre genérico de
inhibidores enzimáticos. Debemos aclarar que no deben ser incluidos en este grupo
de sustancias, aquellos agentes que producen simplemente una destrucción irreversible
de la enzima, como podrían ser todos aquellos que conducen a su desnaturalización,
como por ejemplo los ácidos fuertes.
La inhibición enzimática es de gran importancia fisiológica, ya que a veces la inhibición
de una sola enzima que forma parte de una cadena de reacciones metabólicas puede
inhibir por completo a todo el proceso metabólico involucrado y ejercer en esa forma un
efecto profundo y a veces fatal sobre el organismo. De más está recalcar la importancia
que este fenómeno tiene en farmacología y toxicología como así también en el
desarrollo de herbicidas e insecticidas. De ahí que el estudio del mecanismo de acción
de los inhibidores se haya constituido en una de las más exploradas de la enzimología
práctica.
Los inhibidores pueden clasificarse en dos grandes grupos:
1) Irreversibles.
2) Reversibles
i) competitivos
ii) no competitivos
En el primer caso la enzima no recobra su actividad por remoción del inhibidor libre.
Esto es debido a que el inhibidor irreversible, actúa por lo general modificando
irreversiblemente o aún destruyendo algunos de los grupos esenciales del centro activo.
En el segundo caso, la enzima recobra su actividad por remoción del inhibidor libre (por
ejemplo por simple diálisis). Lo cual demuestra que hay un equilibrio entre el inhibidor
libre y la enzima. Ejemplos de uno y otro tipo de inhibidores los encontramos entre
los llamados reactivos de tioles. Estas sustancias tienen la particularidad de reaccionar
específicamente con grupos sulfhidrilos de las proteinas, aportados por los grupos
laterales correspondientes a los residuos de cisteína. Existen ciertas enzimas que
requieren para actuar que algunos de esos grupos sulfhidrilos estén libres. Es evidente
que en esos casos los reactivos de tioles, al bloquear los grupos sulfhdrilos esenciales de
estas enzimas, pueden actuar como inhibidores. Entre algunos reactivos de tioles
podemos mencionar al p-cloromercuribenzoato y el alquilante iodoacetato, que
ejemplifican a un inhibidor reversible y aun inhibidor irreversible respectivamente.
Ambos reaccionan con los grupos sulfhidrilos libres (-SH) de las proteinas, pero en
tanto que el primer lo hace formando un complejo reversible (mercaptida), el segundo
forma un carboximetil-derivado de gran estabilidad, incapaz de disociarse.
Cl-Hg COO
-
Hg COO
-
+ ClH
En zi m a Enzima i nact iva
P-cloromecuribe nzoato
pf3
pf4
pf5
pf8
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pfa

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Inhibición enzimática

La actividad de una enzima puede ser disminuida o eliminada completamente por la acción de ciertas sustancias a las cuales se las conoce con el nombre genérico de inhibidores enzimáticos. Debemos aclarar que no deben ser incluidos en este grupo de sustancias, aquellos agentes que producen simplemente una destrucción irreversible de la enzima, como podrían ser todos aquellos que conducen a su desnaturalización, como por ejemplo los ácidos fuertes. La inhibición enzimática es de gran importancia fisiológica, ya que a veces la inhibición de una sola enzima que forma parte de una cadena de reacciones metabólicas puede inhibir por completo a todo el proceso metabólico involucrado y ejercer en esa forma un efecto profundo y a veces fatal sobre el organismo. De más está recalcar la importancia que este fenómeno tiene en farmacología y toxicología como así también en el desarrollo de herbicidas e insecticidas. De ahí que el estudio del mecanismo de acción de los inhibidores se haya constituido en una de las más exploradas de la enzimología práctica. Los inhibidores pueden clasificarse en dos grandes grupos:

1) Irreversibles.

2) Reversibles

i) competitivos

ii) no competitivos

En el primer caso la enzima no recobra su actividad por remoción del inhibidor libre. Esto es debido a que el inhibidor irreversible, actúa por lo general modificando irreversiblemente o aún destruyendo algunos de los grupos esenciales del centro activo. En el segundo caso, la enzima recobra su actividad por remoción del inhibidor libre (por ejemplo por simple diálisis). Lo cual demuestra que hay un equilibrio entre el inhibidor libre y la enzima. Ejemplos de uno y otro tipo de inhibidores los encontramos entre los llamados reactivos de tioles. Estas sustancias tienen la particularidad de reaccionar específicamente con grupos sulfhidrilos de las proteinas, aportados por los grupos laterales correspondientes a los residuos de cisteína. Existen ciertas enzimas que requieren para actuar que algunos de esos grupos sulfhidrilos estén libres. Es evidente que en esos casos los reactivos de tioles, al bloquear los grupos sulfhdrilos esenciales de estas enzimas, pueden actuar como inhibidores. Entre algunos reactivos de tioles podemos mencionar al p-cloromercuribenzoato y el alquilante iodoacetato, que ejemplifican a un inhibidor reversible y aun inhibidor irreversible respectivamente. Ambos reaccionan con los grupos sulfhidrilos libres (-SH) de las proteinas, pero en tanto que el primer lo hace formando un complejo reversible (mercaptida), el segundo forma un carboximetil-derivado de gran estabilidad, incapaz de disociarse.

Cl-Hg COO -^ Hg^ COO

- (^) + ClH

Enzima Enzima^ inactiva

P-cloromecuribenzoato

En el primer caso, una vez establecido el equilibrio, si se elimina el p- cloromercuribenzoato, la reacción, por el principio de acción en masa, se va a desplazar hacia la izquierda, disociándose el complejo enzima-inhibidor en enzima libre e inhibidor. Si la eliminación es total, toda la enzima recuperará su forma libre activa. En cambio, en el segundo caso, una vez formado el carboximetil-derivado, es imposible disociarlo dada su extraordinaria estabilidad, por ende, la eliminación del exceso del inhibidor será ineficaz para hacer recuperar la actividad original. Otro ejemplo de inhibición irreversible es el representado por los llamados gases neurotóxicos que se desarrollaron durante la 2ª guerra mundial, para ser utilizados como gases de guerra. Son sustancias que reaccionan con el grupo alcohólico del resto lateral correspondiente a la serina de algunas enzimas que tienen un hidroxilo en el centro activo y que es necesario para que la enzima presente actividad. Una enzima de ese tipo es la acetilcolinestearasa que interviene en los procesos de transmisión del impulso nervioso, causando entre otros efectos, parálisis de los músculos estriados.

acetilcolinestearasa

Acetilcolina + H2O ↔ colina + acetato

Una de las primeras sustancias que se utilizó con es fin es el diisopropilfluorofosfato que reacciona con la enzima en la siguiente forma.

En la inhibición no competitiva , se postula que el inhibidor se une con la enzima en otro sitio, que no es aquel por el cual se une el sustrato. Por esa razón la unión del sustrato con la enzima no es afectada por la presencia del inhibidor y se puede formar entones un complejo enzima- sustrato-inhibidor. Pero este complejo es catalíticamente inactivo y no puede escindirse en productos de la reacción y complejo enzima-inhibidor. En este caso, las posibles formas de reaccionar del sustrato y el inhibidor con la enzima se representan por las ecuaciones siguientes. Este tipo de inhibición se caracteriza entonces porque no puede ser revertido por un aumento de la concentración de sustrato. El sustrato no puede desplazar al inhibidor unido a la enzima. Experimentalmente ambos tipos de inhibición pueden distinguirse fundamentalmente mediante la aplicación del método de Lineweaver y Burk antes descripto a la reacción enzimática con y sin inhibidor en cuyos respectivos casos se obtendrán los gráficos indicados en las figuras siguientes.

Como puede apreciarse en el gráfico, en el caso de la inhibición competitiva la Vmáx para una dada cantidad de enzima no se modifica por el agregado de inhibidor porque agregando una concentración lo suficientemente grande de sustrato se puede desplazar completamente al inhibidor. Sin embargo, el Km aumenta porque la presencia del inhibidor hace que se necesite una mayor cantidad de sustrato para saturar a la enzima que la que se necesitaría si el inhibidor no estuviera presente. En contraposicion a lo anterior, en la inhibición no competitiva, el inhibidor disminuye el valor de la Vmáx sin modificar la Km ya que la unión del sustrato a la enzima no está alterada por la simultánea unión del inhibidor.

Sin inhibidor

-1/Km -1/Km inh 1/(S)

0

1/Vo

1/Vmáx

Vmáx Sin inhibidor

Vmáx/

Km Km inh (sustrato)

10

Vo

sin inhibidor

con inhibidor

Michaelis-Menten Lineweaver-Burk

Inhibición competitiva

Sin inhibidor

-1/Km -1/Km inh 1/(S)

0

1/Vo

1/Vmáx

Vmáx Sin inhibidor

Vmáx/

Km Km inh (sustrato)

10

Vo

sin inhibidor

con inhibidor

Michaelis-Menten Lineweaver-Burk

Inhibición competitiva

En resumen.

Tipo de Inhibicion reversible

Sitio de unión de la enzima

En presencia del inhibidor

esquema

competitiva

  • La unión del substrato y del inhibidor son mutuamente excluyentes
  • A muy altas concentraciones de sustrato desaparece la inhibición
  • Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - el valor de Km aumenta - Se mantiene el valor de Vmáx

no competitiva

  • Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima
  • Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato - El valor de Km se mantiene - Disminuye el valor de Vmáx

1/(S)

1/Vo

-1/Km

1/Vmáx inh

1/Vmáx (sustrato)

Vo

Michaelis-Menten Lineweaver-Burk

Inhibición NO competitiva

Vmáx

Vmáx/ Vmáx inh

Vmáx inh/

Km = Km inh

sin inhibidor

con inhibidor

sin inhibidor

con inhibidor

1/(S)

1/Vo

-1/Km

1/Vmáx inh

1/Vmáx (sustrato)

Vo

Michaelis-Menten Lineweaver-Burk

Inhibición NO competitiva

Vmáx

Vmáx/ Vmáx inh

Vmáx inh/

Km = Km inh

sin inhibidor

con inhibidor

sin inhibidor

con inhibidor

inhibición aumente o disminuya respectivamente la velocidad de toda la vía metabólica involucrada de acuerdo a las necesidades de la célula.

Modelos para las enzimas alostéricas

Se han propuesto algunos modelos para interpretar las interacciones entre la proteina, el sustrato y el o los efectos de las enzimas alostéricas. Entre ellos vamos a describir brevemente los debidos a Monod, Wyman y Changeux (1965) y a Koshland, Nemethy y Filmes (1966). El primero de ellos, conocido con el nombre de modelo concertado simétrico , parte del supuesto de que la proteina regulatoria (oligómero) consiste de dos o más subunidades idénticas (protómeros) que se asocian de tal manera que la molécula posea por lo menos un eje de simetría. Cada subunidad contiene un sitio de unión para cada sustrato y efector manteniéndose la simetría de la molécula. Cada subunidad puede existir en dos estados conformacionales distintos denominados estados R y T, que difieren en la posibilidad que poseen de unirse al o los sustratos y los efectores. Así R tiene afinidad por el sustrato mientras que T tiene baja afinidad por el mismo. La transición de una conformación de una subunidad es concertada con la correspondiente transición en las subunidades vecinas de tal manera que todas las subunidades se encuentren en el mismo estado conformacioneal simultáneamente y la simetría molecular se mantenga. Por otra parte el equilibrio entre la forma R y la forma T, se establece en ausencia de los sustratos y efectores.

En la figura se representa esquemáticamente este modelo para una proteina oligométrica constituida por dos subunidades en la cual sustrato S y el efector positivo A se unen sólo al estado R, mientras que el inhibidor I lo hace exclusivamente al estado T. En ausencia de sustrato y activador el equilibrio entre los estados T y R está desplazado hacia el estado T, es decir la mayor parte de las moléculas de la enzima se

encuentran al estado T, pero al agregarse el sustrato S o el activador A, y al unirse selectivamente estos ligandos a las moléculas que se encuentran en el estado R, el equilibrio se desplaza en este sentido. Como la transición entre las formas T y R para las subunidades es concertada, es suficiente la unión de la molécula de sustrato o activador a una sola de las subunidades para que la otra quede en la forma R dejando de esa forma disponible otro sitio de más alta afinidad para el sustrato. Cuanto más sustrato o activador se agregue mayor será el número de oligómeros en la forma R, observándose en consecuencia lo que se denomina un efecto coorperativo positivo del estrato y del activador, que se traduce en una curva de saturación sigmoide. En el primer caso (sustrato) y de acuerdo a lo que se indicó anteriormente el efecto será homotrófico cooperativo o positivo y en el segundo caso (activador), heterotrófico cooperativo o positivo. Pero si se agrega activador en cantidad suficiente, el equilibrio quedará totalmente desplazado hacia la forma R, y todas las moléculas del oligómero estarán exclusivamente en esa forma y la adición del sustrato en ese caso, no podrá producir un mayor desplazamiento del equilibrio, comportándose entonces el sistema como un sistema para el cual es válido un tratamiento cinético del tipo Michaelis- Menten, obteniéndose entonces una curva de saturación para el sustrato de tipo hiperbólico. En contraste con lo que ocurre con el sustrato y el activador, el inhibidor se une exclusivamente a la forman T. Si debido a la presencia de sustrato en concentración saturante, la enzima se encontraba originalmente casi exclusivamente en el estado R, el agregado de inhibidor producirá un desplazamiento hacia la forma T y por ende la curva de saturación para el sustrato se hará más sigmoide a medida que aumenta la concentración del inhibidor. El efecto en este caso será heterotrófico negativo (del inhibidor con respecto al sustrato).

El modelo de Koshland, Nemethy y Filmer también denominado secuencial se basa en la explicada teoría del ajuste inducido. El modelo establece que la unión de un ligando (sustrato, activador o inhibidor) a una de las subunidades de la molécula enzimática oligométrica, produce un cambio conformacional de dicha subunidad. Esa distorsión en una subunidad puede afectar secuencialmente la estabilidad y configuración de las subunidades vecinas, en la misma forma que la distorsión de una parte de una cadena polipeptídica, aumentando o disminuyendo la afinidad de las mismas por el sustrato. La figura siguiente ilustra lo dicho para el caso de una enzima alostérica que posee dos subunidades, cada una de ellas capaz de unirse a una molécula de sustrato y que presenta un efecto homotrófico positivo de S sobre S.

En el modelo secuencial las interacciones entre las subunidades son posibles estando las subunidades en distintos estados conformacionales.

La regulación covalente más frecuente se realiza por modificación de los residuos de tirosina, serina y/o treonina de las enzimas por un proceso de unión o eliminación de grupos fosfatos. Existen también enzimas cuya actividad es modulada por la inserción covalente de otros grupos., como se muestra en la siguiente tabla.

En la siguente tabla se dan ejemplos de algunas enzimas cuyas actividades estan reguladas por modificación covalente que implica fosfo- desfosforilaciones.

3) MODULACIÓN ALOSTÉRICA.

Ya se describió anteriormente. Algunos casos particulares dan origen a diferentes modos regulatorios. En algunas vías metabólicas, la enzima que cataliza la primera etapa de la serie suele ser inhibida por el producto de la última. Cuando la concentración de ese producto final aumenta, ello indica que su elaboración excede las necesidades y se frena el funcionamiento de la vía reduciendo la actividad de la enzima reguladora. Se habla de un proceso de retroinhibición.

También puede suceder que una enzima sea estimulada por algún agente que se acumula en el medio. Cuando existe un exceso de sustrato, él mismo promueve su utilización activando a la enzima.

4) INDUCCIÓN O REPRESIÓN DE LA SINTÉSIS DE LA ENZIMA.

Implica el control de la síntesis de las enzimas regulatorias involucradas en un camino metabólico. Se habla entonces de inducción enzimática o represión enzimática según que la velocidad de producción de una dada enzima, o de un conjunto de enzimas metabólicamente relacionadas, y por ende su concentración celular, sea aumentada o disminuída respectivamente como respuesta a las necesidades de la célula, actuando por lo general un metabolito particular como señal desencadenante del proceso. En el caso de la inducción, ese metabolito puede ser el mismo sustrato de la enzima (metabolito inductor), y en la represión, el producto final de la vía metabólica de la cual la enzima reprimida forma parte (metabolito represor). Este mecanismo es mucho más lento que los anteriores ya que implica la síntesis o degradación de las enzimas involucradas.

E1 E2 E3 E

S1 → A → B → C → P

E1 E2 E3 E

S 1 → X → Y → Z → P