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La práctica de laboratorio de electroforesis en gel de agarosa, una técnica fundamental en biología molecular. Se detallan los pasos para la preparación del gel, la realización de la electroforesis y la cuantificación de la concentración de adn mediante espectrofotometría. El documento incluye información sobre los elementos necesarios para la electroforesis, el funcionamiento de la cámara, las diferencias entre geles de agarosa y acrilamida, el uso de buffers y marcadores de peso molecular, así como las principales aplicaciones de esta técnica en el análisis de ácidos nucleicos y proteínas. Con esta información, los estudiantes podrán comprender los fundamentos de la electroforesis en gel de agarosa y su importancia en la biología molecular aplicada.
Tipo: Esquemas y mapas conceptuales
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MEXICALI, B.C. MÉXICO 24 /MARZO/
Objetivo : Conocer y practicar la técnica de electroforesis en gel de agarosa para verificar la integridad y calidad de ADN purificado de una muestra biológica, y cuantificar su concentración en un espectrofotómetro. Preparación del gel de agarosa
En la práctica se realizó una electroforesis en gel de agarosa, es un método muy importante para realizar la cuantificación de la concentración de ADN. En la electroforesis se inyectaron las muestras de ADN y se observo como la cadena iba avanzando por gel, esto debido a que el ADN tiene carga negativa y al ponerla en el polo negativo de la electroforesis, la cadena de ADN tiende a ir hacia el polo positivo. Además, se agregó Bromuro de etidio, para que se una al ADN y podamos ver en un transiluminador como avanzo la cadena. Por ultimo se realizo la cuantificación del ADN en un espectrofotómetro.
a. Enlista los elementos necesarios para una electroforesis. Cámara de electroforesis, Peine para pocillos, Transiluminador, Fuente de poder, Gel, Buffer de corrimiento, Marcador de peso molecular, Buffer de carga. b. Describe cómo funciona la cámara de electroforesis. La cámara de electroforesis permite la generación de un campo eléctrico alrededor de un gel en el que se depositan las muestras. Se genera dentro de una solución amortiguadora en la que se encuentra sumergido el gel que contiene las muestras; el alto contenido de electrolitos permite la transmisión de la corriente eléctrica, manteniendo el pH estable al paso de la corriente. La cámara cuenta con dos polos que se conectan a una fuente de energía. En las cámaras de electroforesis vertical el polo positivo se encuentra en la parte inferior de la cámara y en las horizontales, en uno de los extremos. En ambos tipos de cámaras el polo positivo se identifica con color rojo y el negativo con negro. c. Describe cuáles son las principales diferencias entre un gel de agarosa y un gel de acrilamida. La agarosa posee ventajas sobre la acrilamida, ya que no es un compuesto tóxico y permite realizar el análisis de ácidos nucleicos con pesos moleculares variados, según la concentración de agarosa que se emplee.. El tamaño de los poros de la matriz del gel depende de la concentración de agarosa utilizada y la concentración de agarosa es inversamente proporcional al tamaño del poro obtenido; esto es, a mayor concentración, menor tamaño de los poros, y viceversa, si los poros son pequeños la migración del ácido nucleico es más lenta. El tamaño del poro de un gel de acrilamida está determinado por la concentración total de acrilamida presente (acrilamida + bisacrilamida), que generalmente se maneja en proporción de 19:1. Regulando la concentración de ambas y su proporción se consiguen distintas porosidades, siempre menores que la de los geles de agarosa. Para la separación de ácidos nucleicos se usan geles de agarosa o acrilamida y para proteínas, sólo de acrilamida. d. ¿Para qué sirve el buffer de corrida y de qué está hecho? El buffer de corrimiento es de la misma composición y pH que el buffer con el que se prepara el gel de resolución, ya sea de agarosa o de acrilamida. Éste proporciona el medio para la transmisión de la corriente eléctrica y mantiene el pH sin variaciones mientras se realiza el corrimiento.